così a occhio sembrano proprio dei conflitti di clock. Di solito questo succede quando ci sono due macchine che lavorano su due clock differenti.
A me era successo usando un convertitore AD collegato via MADI a una scheda audio RME, solo che la RME aveva il clock internal (un bug di quella scheda, ma vabbè non è questo il punto) e succede questo.
Il fatto che non sia costante dipende dal fatto che le due macchine cercano di linkarsi ma non riescono per cui finchè l'errore tra i due clock è accettabile non senti niente ma poi ogni tanto si riallineano ed ecco il click..solitamente meno complesso è il segnale che registri meno frequenti sono sti click.
Nella foto sopra li vedi come piccolissime righe verticali che appaiono ogni tanto, mentre in questa li vedi nel dettaglio a livello di forma d'onda, se noti è proprio spezzata nel punto in cui si riallineano:
di solito il buffer crea dei buchi di segnale non questi piccoli saltini!
Detto questo pippone, siccome mi par di capire che tu hai come catena solo scheda audio-pc e non altre macchine digitali in mezzo, potrebbe anche essere banalmente il cavo usb difettoso
Ci sono anche degli enormi e fastidiosissimi disturbi in frequenze fisse (le linee belle evidenti orizzontali), le cause potrebbero essere tantissime! Sulla mia focusrite solo 1gen da battaglia ho lo stesso problema però solo sui 10kHz e solo con gain molto alto.